In GeoGebra kun je eenvoudig vergelijkingen invoeren. Dat doe je in de invoerbalk onderaan het venster. Je typt de formule gewoon in het vak achter de knop invoer en [ENTER]. Het sterretje * is het vermenigvuldigingsteken. De lijnen die je in dit onderdeel tegenkomt kun je zelf eenvoudig maken, gebruik eventueel de helpfunctie via het menu "Help" ; hij is vrij duidelijk en uitgebreid.
Een vergelijking met parameters kan ook. Je voert dan eerst een waarde voor de parameter in, bijvoorbeeld `a=2` en dan `b=1` en `c=6` . Vervolgens voer je een vergelijking in `x` en `y` in waar deze parameters in voorkomen, bijvoorbeeld `a*x+b*y=c` . Je kunt de parameters als schuifbalkjes zichtbaar maken door in het algebravenster met de rechter muisknop op de parameter te klikken en "object tonen" te kiezen.